地理位置
棲蘭山樣區(以下簡稱本樣區)在台灣東北部雪山山脈的棲蘭山區(24°35'N, 121°24'E)，位於林務局羅東林區管理處太平山事業區 32 林班地，100 號林道 14.5 公里南處，海拔高約 1400-1800 公尺。 上圖紅色方框為本樣區劃設範圍。
地形與氣候
本樣區地形為一面向東南方的山坡，坡度相對平緩，平均坡度約為 15°。本樣區屬暖溫帶氣候區，年均溫為 13.4℃。 夏季雨量除了地形雨外，受颱風影響極大；秋冬季則由東北季風帶來降雨，全年沒有明顯的乾濕季區分，年雨量介於 2000 公釐至 5000 公釐之間。 本樣區位於霧林帶內，雲霧年平均籠罩時間為 3118 小時，約佔全年總時數的 35%，由 2004 年 5 月至 2006 年 4 月對雲霧沉降的觀測顯示，雲霧年沉降量為 204 公釐，約佔總大氣水沉降的 4%。
土壤條件
本樣區土壤由變質板岩和石英岩發育而成，屬於一種壤土質地的 Lithic Leptosol，含石率(>0.2mm)高達 80-90 vol%，有機層土壤約為 10 公分厚，碳氮比為 17。 土壤的 pH 約為 3.5，為酸性土壤。土壤中可用的 Ca、Mg、和 K 集中於有機層和 0-5 公分的礦質層中，深層土壤中的可交換性陽離子幾乎全為 Al。 由於長年多雨的氣候條件，造成土壤含水率極高且終年沒有太大的變化。
植被
本樣區為天然下種更新林，原始檜木林於 1960 年代陸續砍伐，由殘餘檜木母株進行天然下種更新(1961~1978 年間下種或補植)。 由 2002 年對樣區內 0.2 公頃小樣區進行的調查顯示，本樣區有 17 科 26 屬 33 種維管束木本植物，除了台灣扁柏之外，其餘皆為被子植物。 本樣區植株密度為每公頃 1820 棵，台灣扁柏總胸高斷面積佔本樣區所有植物總胸高斷面積的 81.8%，為主要優勢種。 其他依次為豬腳楠(Machilus thunbergii)、台灣樹蔘(Dendropanax dentiger)、香葉樹(Lindera communis)、薯豆(Elaeocarpus japonicus)、白花八角(Illicium anisatum)等闊葉樹。 本樣區台灣扁柏樹齡約在 10 至 50 年之間，平均樹高約為 10.3 公尺。