民國八十三年七月一日本校正式成立，為配合政府推動企業國際化及金融國際化、自由化政策，培養中高級財務金融管理人才與目前國內東部地區尚未設置財務金融學系培育此類專才，本系之設立，即在加速此等人才之培育，以應日益殷切之需求；本校財務金融學系於民國九十一年夏正式成立招生，並於民國九十六年成立公司理財碩士學位學程，希望有志於財務金融領域之莘莘學子慎重選擇這個經過長期細心規劃所成立的新學系。　

本校早期為配合政府政策，推展國建計畫之「區域平衡發展」政策及達成「產業東移」之目標，在東部設立一所國立綜合大學。本系設立宗旨在於分工專司在台灣東部傳播企業國際化及金融國際化、自由化政策之重要性；並協助台灣東部產業推動企業國際化，培養台灣東部中高級財務金融管理人才。近年來企業國際化及金融國際化、自由化已蔚為潮流，政府為因應此一情勢，陸續推動各項重大政策，如亞太營運中心、亞太金融中心、產業東移、南進政策及國際企業策略聯盟等；此外，更採取多項政策以積極健全資本市場、外匯市場及金融制度，並引進多種金融工具，以利企業之靈活經營與運作。政府財經機構為落實上述政策，應行興革之事項尚多，極待注入更多具有前瞻性、國際觀之中高級財務金融管理人才。

目前國內東部地區除了本校之外，未有大專院校設置財務金融學系培育此類專才，本系之設立，即在加速此等人才之培育，已應日益殷切之需求。