三合一選舉結果揭曉，國民黨失去宜蘭和花蓮兩縣，在其他縣市的得票也不理想；綠營反而得票大幅成長。學者解讀，這顯示馬總統的光環褪色，尤其八八風災更讓外界質疑國民黨的執政能力。學者認為，這次選舉的結果對馬主席是必須正視的警訊，明年的直轄市長選舉如果無法突顯出執政的亮麗政績，將可能直接挑戰馬總統的連任之路。

    三合一選舉結果揭曉，國民黨雖然在縣市長方面固守12席，但是民進黨收復宜蘭縣，花蓮縣也由脫黨的傅崑萁勝出，更重要的是民進黨在各地的得票大幅成長，部分藍軍勝選的縣市到最後是驚險勝出。學者解讀，這明白顯示國民黨主席馬英九的光環褪色，尤其馬政府的政績、政策表現都不理想，八八風災的處理讓外界質疑國民黨的執政能力。另一方面，學者認為馬主席對地方選舉的策略和操作需要更加細膩。東華大學民族學院院長施正鋒說，國民黨的真正問題，其實就是藍營的內鬨。施政鋒說，某種程度是藍的內鬨，或應該說馬總統要削藩卻未必那麼成功。

    高師大教授劉廷揚表示，馬主席處理中央和地方的磨合，有很大問題，劉廷揚說，馬英九長期在和台灣生態不相近的台北都會區長大，歷練也多半在中央政府，對地方生態有隔閡。現在看來，馬英九雖然掌握很大權力，卻是個不懂使用權力的人，反而被自己的法匠性格限制，在山頭林立的國民黨內部造成「令不出京城」的狀況。

    文化大學教授鈕則勳觀察宜蘭縣的選情，認為馬主席10次前往宜蘭輔選，反而把選情拉高到藍綠對決的態勢，但是綠軍的動員能量卻遠高於藍營。學者認為，這次選舉結果是馬主席必須正視的警訊，明年的直轄市長選舉如果無法突顯出執政的亮麗政績，那麼不只明年可能讓綠營囊括半數以上直轄市，更可能直接威脅馬總統的連任之路。