針對台灣總統馬英九注銷前總統陳水扁執政時的國務機要費機密，在野的民進黨星期五控告馬英九此舉涉及了內亂外患罪。

民進黨立法院黨團總召柯建銘等人星期五前往台北地檢署，控告馬英九總統涉及了內亂外患罪。

柯建銘表示，總統的國務機要費和首長的特別費一樣，都是歷史的共業，國家不應該浪費資源再繼續追究下去，而應該用別的方式來解決。

柯建銘還指出，他在提出法律告訴前，並沒有和陳水扁前總統見過面或是通過電話，但是，為了維持國家的憲政體制和國家安全，黨團必須對馬英九提告。

柯建銘還不滿的說，馬英九不好好的拼經濟，卻不斷的搞政治惡斗，已經喪失了國家領導人應有的風範，"馬英九是以紅衫軍的思維來追殺前總統陳水扁。"

民進黨的告發狀指出，在中國無時無刻、無所不用其極打壓台灣國際空間的時候，馬英九總統注銷國務機要費機密的行為，等于是讓中國不費吹灰之力，就可以取得想要的機密，將陷台灣于萬劫不復的地步。

不過，面對綠營的提告，馬英九總統在面對媒體詢問時，並沒有多做表示。總統府發言人王郁琦再次強調，總統府的做法經得起考驗，

"我們認為，轉移焦點並無法改變那些資料不是國家機密的事實。"

東華大學原住民民族學院院長施正鋒教授認為，陳水扁前總統的國務機要費如果解密的話，可能再次引發藍綠陣營的對立，也可能外泄台灣秘密外交的經費，

"我會擔心，好不容易，選後已經沉澱的情緒，是否讓民進黨有理由或是借口引發政治沖突，第二，如果真的解密的話，到底有罪，沒罪，是不是到最後判了有罪，然後馬英九再出來特赦呢？我們也不知道，不過，我最擔心的還是外交，國安的部分。"

2006年，由于質疑陳水扁前總統和家人以不實的收據來核銷國務機要費，當時在野的泛藍陣營發動了倒扁以及反貪腐的行動，藍營甚至提出了2次罷免陳水扁總統的提案，不過，並沒有成功。

台灣前副總統呂秀蓮表示，後任總統全盤否定前任總統的憲法權利，國家將因此動蕩不安，她建議，陳水扁前總統應該請大法官釋憲。

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